Las escuelas participantes se adhieren al programa mediante una convocatoria abierta, incorporándose preferentemente las que se ubican en polígonos poblacionales definidos por el Programa para la Prevención Social de la Violencia y la Delincuencia 2014-2018.
Los apoyos económicos que reciben esos planteles los definen las autoridades educativas locales con base en los recursos que la Federación determina para cada entidad, y con ello se han realizado, de acuerdo a sus necesidades, mejoras como adquirir señalamientos de rutas de evacuación, mallas perimetrales, portones, servicios de videovigilancia o equipo de iluminación, entre otras orientadas a la protección de los espacios escolares.
Asimismo, estas escuelas han desarrollado acciones de capacitación al personal educativo y la entrega de material didáctico, así como actividades para la promoción de la convivencia, como ferias temáticas, torneos deportivos y eventos culturales, además del establecimiento de vínculos entre las comunidades escolares y los organismos de seguridad locales, lo que ha permitido reforzar las medidas de protección y orientación para alumnos y personal.
Al surgir el programa Escuela Segura en 2007, se abordó como una estrategia para prevenir situaciones de riesgo, y actualmente ha ampliado sus alcances y planteado una mejora en su enfoque, en el que se considera una acción integral de convivencia y seguridad escolar.
En las Escuelas Seguras se promueven distintas acciones de convivencia planteadas por la Política Nacional de Convivencia Escolar que desarrolla la SEP en coordinación con otras instancias del gobierno federal, como el Proyecto a Favor de la Convivencia Escolar, una acción de carácter preventivo y formativo que abona a la mejora de la convivencia sana, pacífica y democrática en el entorno escolar.
Además, durante el ciclo escolar 2014-2015 se distribuyeron alrededor de 323 mil textos que conforman la Biblioteca de la Gestión de la Convivencia Escolar, dirigida a los supervisores e integrantes de los Consejos Técnicos Escolares de los planteles del Programa Escuela Segura y Escuelas de Tiempo Completo.