El Nikkei, que incluye a los 225 títulos más representativos del mercado, cayó 276,53 puntos, hasta 28,489.13 enteros.
El Topix, que agrupa a las firmas de la primera sección, las de mayor capitalización, retrocedió un 0.68 % o 13.78 puntos, hasta situarse en 2,005.58 unidades.
El parqué tokiota abrió este jueves a la baja, tras registrar el archipiélago más de 10,000 contagios diarios de covid-19 en medio de una sexta ola, debido a la expansión de la variante ómicron, una cifra que no se alcanzaba desde septiembre pasado y que despierta nuevos temores por el impacto económico.
La fortaleza del yen frente al dólar perjudicó además a las empresas exportadoras.
El sector de los instrumentos de precisión, el minorista y el servicios lideraron las principales pérdidas.
El fabricante de componentes para semiconductores Lasertec aglutinó el mayor volumen de operaciones de la jornada y descendió un 1.75 %.
El grupo de telecomunicaciones e inversión Softbank perdió un 2.05 %; Fast Retailing, empresa matriz de la cadena de tiendas de ropa Uniqlo, se dejó un 1.92 %, y Keyence, productor de sensores de imagen, descendió un 2.13 %.
Destacaron por su avance en esta jornada el fabricante automovilístico nipón Toyota Motor, que anotó una subida del 2.22 %, y la empresa de semiconductores Tokyo Electron, que subió un 0.35 %.
En la primera sección, 527 empresas avanzaron frente a 1,553 que descendieron, mientras que 105 cerraron sin cambios.
El volumen de negociación ascendió a 2.76 billones de yenes (21,104 millones de euros).